西昌学院农业科学学院秉承80余年厚重历史，紧跟国家战略急需，深耕攀西大地，对高原及山地特色作物（马铃薯、荞麦、洋葱、高原粳稻、饲用大麦等）和野生植物资源的研究达到国内先进水平。共有4个植物生产类专业，其中农学为国家级一流专业建设点（2022年），园艺为四川省一流专业建设点（2019年），烟草为行业特色、省内唯一本科专业，智慧农业为新开专业（2024年）。作物学学科先后立项为国家民委重点学科（2019年）、四川省“双一流”建设贡嘎计划建设学科（2023年）。学院遵循立德树人根本，突出应用导向，培养出一大批富有“三农”情怀、敢于创新创造并能适应地方经济发展的优秀应用型人才。

根据国务院学位委员会下发的《国务院学位委员会关于下达2024年审核增列的博士、硕士学位授予单位及其学位授权点名单的通知》（学位〔2024〕13号），西昌学院成为硕士学位授予单位，招生专业包括农业相关的农艺与种业（095131）。该学位点现有教职工106人，其中高级职称56人，博士50人，博士在读10人。

本院农艺与种业的研究方向紧密结合区域资源优势和产业瓶颈，近年来取得了丰硕成果。依托攀西特色作物研究与利用四川省重点实验室，在苦荞、马铃薯、洋葱等高原与山地作物种质资源收集与品种选育方面取得突破，收集保存超过全球一半的苦荞资源及特色植物标本8200份，选育的45个山地特色作物新品种已成为当地民族群众栽培的主要种源；洋葱育种水平全国领先，建立的西昌科威洋葱种业入选国家农作物种业阵型企业，实现进口替代，解决“卡脖子”难题并实现进口替代。同时，依托西昌国家级玉米制种基地、攀西植物医院、苦荞科技小院等平台，在高原与山地作物高产栽培技术研发与推广方面取得显著成效，主推攀西地区秋冬作马铃薯栽培技术、苦荞轻简栽培技术、“烟草+”特色作物高产栽培技术等，增加收益超过100亿元。此外，依托四川国光农化股份、四川天艺种业、凉山新技术开发等产学研基地，在高原山地及干热河谷地区土地高效耕作方式研究与应用方面取得重要进展，研究推广“粮经复合”“林下经济”等高效农业耕作方式，转化应用成果13项，新增利润2.52亿元，为区域农业可持续发展提供科技和智力支撑。近五年获省部级科技奖励8项，申报获批国家自然科学基金项目7项，科技部、四川省科技厅等省部级项目11项，全国农业技术推广服务中心、四川省农业技术推广总站、中烟工业有限责任公司等项目27项。在International Journal of Biological Macromolecules、Construction and Building Materials、Genes、Plants、Friontiers in Plant Science、园艺学报、中国烟草学报等刊物上发表论文84篇，编写教材1部，专著7部。

本院已有丰富的硕士研究生培养经验，研究生培养方案趋于完善。凭借稳定的研究方向和学科优势，近五年与四川农业大学、西华师范大学等高校联合培养硕士研究生 45 名。其中，专业硕士33名，学术硕士12名，涉及的专业领域包括农艺与种业、作物遗传育种、作物栽培学与耕作学、资源利用与植物保护等，成果丰硕，成为农业领域教学科研骨干及企业技术管理骨干，并得到用人单位的高度评价。