中西医结合基础学科于1998年由国务院学位评定委员会批准为硕士学位授权点。2009年获批建设“国医大师李济仁”工作室，“中医专病—风湿病”连续获批为安徽省“十二五”、“十三五”中医重点专科专病建设项目，2012年“中医痹病学”获批国家中医药管理局重点学科，2013年为中国中医科学院博士后科研合作单位。目前本学科拥有专职教师24人，其中，国医大师1人，教授或主任医师4人，副教授或副主任医师10人，具有博士学位者9人，博士后合作导师1人，博士生导师资格1人，中医临床学术和技术第一层次带头人1人。在教学、科研等多方面做出了贡献，率先提出了“临床时间病学与时间医学”与“形体医理学”，获得省科学技术奖三等奖、省高校科学技术奖二等奖等6项，省教学研究成果奖1项，出版专著30余部，编写教材10余部，极大地推动了学科建设。目前代表性研究方向是中西医结合时间治疗学、中西医结合风湿病治疗学、中西医结合神经免疫调节的基础理论研究。