药用活性分子创新制造工程（方向一）：以行业需求的糖苷类、苯丙素类医药中间体为研究对象，借助生物大分子检测技术，分析、筛选开发特定生物功能元件，催化与合成药用活性分子并实现应用。依托省重点学科平台，聚焦药物制备工艺技术培养工程研发人才。

生物制药工程技术（方向二）：以行业需求的工程化细胞规模培养及其目标产物制备为研究对象，通过优化制备路线和生产工艺，实现药用活性物质绿色生物制造。依托省重点产业学院，聚焦生产工程技术培养工程研发人才。