学校设有3个博士后科研流动站（交通运输工程、电气工程、管理科学与工程），4个一级学科博士点（交通运输工程、管理科学与工程、船舶与海洋工程、电气工程），17个一级学科硕士学位授权点，13个专业学位授权类别，52个本科专业。拥有21个省部级重点研究基地。现有1个国家重点（培育）学科，1个上海市高峰学科，2个上海市高原学科，9个部市级重点学科，工程学、计算机科学、社会科学总论、材料科学和环境科学与生态学5个学科进入ESI全球前1%，港航物流学科保持全球领先。5个国家级特色专业，1个国家级综合改革试点专业，15个国家级一流本科专业建设点，6个教育部卓越工程师教育培养计划专业，17个上海市本科教育高地。现有2个国家级实验教学示范中心，2个国家级虚拟仿真实验教学示范中心，5个国家级工程实践教育中心，1个全国示范性工程专业学位研究生联合培养基地。1个国家级职业教育“双师型”教师培训基地（水上运输类）。1个国家级涉外法治人才协同培养创新基地（培育）。设有水上训练中心，拥有4.8万吨散货教学实习船“育明”轮。